1、意思不同：启航仅仅指第一次航行。起航指日常的开始航行、频繁起航，多次航行。
2、词性不同：启航在语句中，通常用作副词使用。起航在语句中，通常用作动词使用。
3、用途不同：启航一般在轮船、客气、火车上用到这个词。起航仅限于在飞机上形容这个词。