在经济行政合同中，违约金和赔偿金是两种不同的概念，计算方法也有所不同。
违约金计算：违约金是为了惩罚合同一方因违反合同而造成的损失，同时也起到约束作用。一般来说，违约金的计算方法可以在合同中约定，也可以根据实际情况进行协商确定。通常的计算方法包括：需要注意的是，违约金和赔偿金在合同中应该明确区分开来，并且在约定时要考虑到双方的利益平衡。另外，在合同中最好注明违约金和赔偿金的计算方法和标准，以免发生纠纷。
举例来说，如果在一份供应合同中规定如果供货方延迟交货，则应支付违约金，而如果因延迟交货给需方造成实际损失，则需方可以要求供货方支付赔偿金。在这种情况下，双方可以根据约定的违约金计算方法和实际损失情况来确定最终的赔偿金额。