恶意注销公司的处理方式： 1、若公司的发起人、股东虚假出资，由公司登记机关责令改正，处以虚假出资金额百分之五以上百分之十五以下的罚款； 2、若抽逃其出资的，由公司登记机关责令改正，处以所抽逃出资金额百分之五以上百分之十五以下的罚款； 3、其他处理方式。