不合法；
1、休年假要扣满勤和补贴还要扣工资是不合理和不合法的行为。
根据《职工带薪休假条例》职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。即：职工在休年休假期间的工资、津贴(不含中夜班津贴、保健津贴)、效益工资按正常出勤发放。
2、 《职工带薪年休假条例》第三条 职工累计工作已满1年不满10年的，年休假5天;已满10年不满20年的，年休假10天;已满20年的，年休假15天。
国家法定休假日、休息日不计入年休假的假期。
《企业职工带薪年休假实施形式》第十一条计算未休年休假工资报酬的日工资收入按照职工本人的月工资除以月计薪天数(21.75天)进行折算。
前款所称月工资是指职工在用人单位支付其未休年休假工资报酬前12个月剔除加班工资后的月平均工资。在本用人单位工作时间不满12个月的，按实际月份计算月平均工资。
职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。实行计件工资、提成工资或者其他绩效工资制的职工，日工资收入的计发形式按照本条第一款、第二款的规定执行。
3、如果未及时支付工资，有两个途径可以要求支付工资：
(1)、劳动者可以到当地劳动局劳动监察投诉;优点：形式简单。缺点：各地执法力度可能不是很大;
(2)、可以到当地劳动局申请仲裁，要求支付工资。如果未签订劳动合同，还可以要求支付未签订劳动合同的双倍工资。如果是以拖欠工资提出的解除劳动关系，还可以要求支付经济补偿金。优点：除了工资外，还可以主张经济补偿、双倍工资等，并且一般都可以最终解决;缺点：申请劳动仲裁就是打劳动官司，程序稍多，需要专业人士指导。