员工因怀孕急辞职，单位扣工资是不合理的。女职工可以向企业主管部门或者劳动监察部门投诉，或者在劳动争议发生之日起一年内向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对劳动行政部门处理决定或仲裁裁决不服的，可向人民起诉。《劳动争议调解仲裁法》第五条规定：发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民提起诉讼。法律依据：《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第五条 发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解;不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁;对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民提起诉讼。