法律分析：公司犯罪认罪认罚后，投资者的权益可能受到影响，但是法律明确规定了保护投资者的途径。投资者可以通过民事诉讼、刑事附带民事诉讼、证券投资者保护诉讼等方式维权。同时，投资者还可以向、交易所等机构投诉，要求追究公司违法行为的责任。
法律依据：
1.《中华人民共和国证券法》第七十一条：“证券市场违法行为造成投资者损失的，投资者有权依法要求追究证券违法行为人的民事责任。”
2.《中华人民共和国刑法》第一百五十四条：“犯罪嫌疑人或者被告人认罪认罚后，有自首情节或者在侦查、审判过程中如实供述自己罪行，积极配合侦查、审判机关查明案情的，可以从轻或者减轻处罚。”
3.《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十五条：“因刑事案件引起的民事纠纷，被害人或者其近亲属、法定代理人可以直接向人民提起民事诉讼。”
4.《中国证券投资者保护基金条例》第六条：“证券投资者保护基金是依法设立，在中国证券市场上从事证券投资的投资者合法权益受到侵害时予以保护的基金。”